コンパックコンピュータ(株)は、バイオ情報の相似性検索高速化ツール『BioChopper』を6月19日に発売した。
『BioChopper』は、相似性検索ツール『BLAST』を分散並列処理することで、検索速度を高速化するというもの。検索対象データベースを複数に分割し、それぞれを計算ノードに割り当てることで並列検索を可能にしている。検索ソフトには米国バイオテクノロジー情報センターが配布している『NCBI-BLAST』を採用しており、12日に発売された『BioCollector』と組み合わせて利用することも可能だ。
『BioChopper』の動作環境は以下のとおり。
- 対応システム……AlphaServer/Tru64 UNIX 5.1a以上、ProLiant/Red Hat Linux 7.2(マルチCPUを推奨)
- HDD……各ノード50GB以上、全ノードの共有ディスク200GB以上
- メモリ……各ノード1GB以上
- ソフトウェア……NCBI-BLAST 2.2.2
価格は98万円から。
